Cours 1 - partie 1 Flashcards

1
Q

Quelle lumière est absorbée par les acides aminés

A

Les ultra violets.

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2
Q

Quels sont les chromophores les plus importants parmi les acides aminés ?

A

Try et Tyr.

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3
Q

Quels sont les trois degrés d’ionisation des acides aminés ?

A

A pH acide, groupe carboxyle protoné et l’acide aminé est cationique.
A pH neutre le carboxyle est déprotoné mais le groupe amine est protoné
A pH alcalin, le groupe aminé est neutre et on a un anion.

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4
Q

Comment se décrit la courbe de titration des acides aminés ?

A

La courbe possède deux phases distinctes correspondant à la déprotonation de deux groupes différents de la glycine.

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5
Q

Comment se caractérise la charge des acides aminés en fonction du pH ?

A

Selon le point isoélectrique pour les acdes sans chaine latérale ionisable : il est égal à (pk1 + pk2)/2.

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6
Q

Quand pH = pI quelles sont les caractéristiques de l’acide aminé ?

A

La charge nette de l’acide est nulle, il est moins soluble dans l’eau et l’acide aminé ne migre pas dans un champ électrique.

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7
Q

En quoi est-ce que les courbes de titration sont utiles ?

A

Mesurer le pKa de chaque groupe ionisable
Prédire la charge électrique des acides aminés à un pH donné
Définir les régions de pouvoir tampon de l’acide aminé.

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8
Q

Combien de valeurs de pKa ont les acides aminés sans chaines latérales chargées ?

A

Seulement deux. Ils peuvent agir comme tampon dans deux zones de pH.

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9
Q

Que provoque l’addition de soude vis-à-vis des ph des acides aminés sans chaine latérale chargées, dans les zones ou elles peuvent avoir un rôle de tampon ?

A

Ne provoque qu’une faible variation de pH.

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10
Q

Quelle différence y’a-t-il entre les courbes de titration des AA sans chaines latérales chargées et avec chaines latérales chargées ?

A

Les courbes de titrations sont plus complexes, et leurs pKa sont discernables si les valeurs de pKa sont séparées par plus de deux unités de pH.

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11
Q

Comment calculer le pI dans un acide aminé avec une chaine latérale chargée ?

A

On identifie l’espèce portant une charge nette nulle, puis on identifie les valeurs de pKa qui encadrent le Zwitter : pK1 et pKr, et on en fait la moyenne.

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12
Q

Combien et quels sont les acides aminésrenfermant des chaines latérales ionisables ?

A

il y en a 7 : K H R D E Y C.

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13
Q

Qu’est-ce que permettent les différences de charges nettes entre les acides aminés ?

A

Permettent de les séparer et de les purifier.

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14
Q

Dans quel sens écrit-on la séquence d’un polypeptide ?

A

Du N term au C term.

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15
Q

Comment nomme-t-on les sous unités identiques d’une protéine ?

A

ce sont des protomères

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16
Q

Détailler la constitution de l’hémoglobine.

A

Deux chaines alpha identiques et deux chaines beta identiques, soit 4 sous unités au total.

17
Q

Comment est-ce que les sous unités de l’hémoglobines sont-elles maintenues ensemble ?

A

Sans liaisons covalentes entre les sous unités !

18
Q

Rappeler ce qu’est une protéine conjuguée et un groupe prosthétique

A

Protéine conjugée : protéine en association permanente de composés autre que les aa : la partie non protéique attache est un groupe prosthétique.

19
Q

Définir cofacteurs et coenzymes.

A

Ce sont des groupes prosthétiques.
Cofacteur : terme général pour un GP non protéique
Coenzymes : GP organique

20
Q

Comment doivent-être les méthodes de séparation de macromolécules pour ne pas altérer l’intégrité des macromolécules ?

A

Doivent être douces et non dénaturantes.

21
Q

Quelles sont les méthodes conventionnelles de séparation ? les méthodes spécifiques ?

A

Convenionelles : par taille, encombrement, charge, densité et hydrophobicité.
Spécifique : exploite les propriétés fonctionnelles des macromolécules.

22
Q

Donner deux méthodes conventionnelles de séparation basées sur la taille et l’encombrement.

A

Chromatographique par filtration sur gel

Electrophorèse sur polyacrylamide ou agarose.

23
Q

Donner deux méthodes conventionnelles de séparation basées sur la charge.

A

Chromatographie par échange d’ions

Isofocalisation

24
Q

Donner une méthode conventionnelle de séparation basées sur la masse et la densité.

A

Centrifugation.

25
Q

Donner deux méthodes conventionnelles de séparation basées sur l’hydrophobicité.

A

Chromatographie sur supports hydrophobes.

Précipitation par les sels.