Chapitre 5 - La transcription

Question 1

Pourquoi est-ce la thymine est remplacée par l’uracile dans l’ARN?

Answer 1

parce que U est moins « coûteux » à produire (un CH3 en moins)

Question 2

Pourquoi l’uracile ne pourrait pas prendre la place de la thymine dans l’ADN?

Answer 2

parce que une des altérations spontanées fréquentes dans l’ADN est la désamination de la cytosine qui se transforme alors en uracile. Une enzyme de réparation, l’uracil DNA glycosylase, enlève le U (créant un site apurique). Si U devait se trouver « normalement » dans l’ADN, ça créerait un problème parce qu’il se ferait toujours enlevé.

Question 3

V ou F. L’ARN est capable de produire des structures secondaires très variées (des
boucles, des nœud, etc.)

Answer 3

V

Question 4

Quel niveau de structure (primaire, secondaire, tertiaire ou quaternaire) donne sa stabilité à l’ARN et peut lui conférer des activités enzymatiques?

Answer 4

tertiaire

Question 5

Quelle enzyme fait la transcription de l’ADN en ARN?

Answer 5

transcriptase (ARN polymérase ADN dépendante)

Question 6

Sur quoi s’attache l’enzyme qui fait la transcription de l’ADN en ARN pour amorcer la transcription?

Answer 6

une séquence sur l’ADN appelée promoteur

Question 7

Quel brin de l’ADN (matrice ou codant) est lu par la transcriptase?

Answer 7

matrice

Question 8

Quel brin de l’ADN (matrice ou codant) a la même séquence que l’ARN produit par la transcriptase?

Answer 8

codant

Question 9

V ou F. La transcriptase se déplace de 3’ vers 5’ sur l’ADN.

Answer 9

V

Question 10

V ou F. Pendant que la transcriptase se déplace sur l’ADN, il y a 2 tours d’ADN qui sont déroulés dans la transcriptase.

Answer 10

F, c’est seulement 1 tour

Question 11

V ou F. La forme et l’organisation générale de l’ARN

polymérase est similaire chez toutes les espèces.

Answer 11

V

Question 12

Quelle forme a la transcriptase?

Answer 12

« pince de crabe »

Question 13

Pourquoi la périphérie de la transcriptase est très variable entre les espèces, mais que son site catalytique comporte de similitudes?

Answer 13

Parce que c’est avec la périphérie de l’enzyme que les protéines régulatrices interagissent avec la transcriptase, et les protéines régulatrices sont propres à chaque espèce.

Question 14

L’ARN polymérase possède 4 endroits (canal) où quelque chose entre ou sort. Quels sont ces canaux et qu’est-ce qui entre ou sort?

Answer 14

• un canal d’entrée des ribonucléotides
• un canal d’entrée du double brin d’ADN
• un canal de sortie de l’ARN synthétisé
• un canal de sortie de l’ADN

Question 15

Le site catalytique de l’ARN polymérase fait intervenir quoi pour l’addition des nucléotides?

Answer 15

2 ions métalliques

Question 16

Quelle ARN polymérase transcrit les séquences codant les protéines?

Answer 16

ARN pol II (2)

Question 17

Quelle ARN polymérase transcrit les séquences codant l’ARNr?

Answer 17

ARN pol I (1)

Question 18

Quelle ARN polymérase transcrit les séquences codant l’ARNt?

Answer 18

ARN pol III (3)

Question 19

V ou F. Il y a des transcriptase spécialisée pour différentes tâches autant chez les bactéries que chez les euca.

Answer 19

F. Les bactéries ont une seule transcriptase, mais les euca en ont 3 et elles sont spécialisées

Question 20

V ou F. L’ARN pol a besoin d’une amorce. Pourquoi?

Answer 20

F. Elle tient très bien le premier nucléotide (beaucoup de stabilité implique liaison très spécifique)

Question 21

V ou F. La majorité de transcrits procaryotes débutent avec le même nucléotide.

Answer 21

V

Question 22

Qu’est-ce qui détermine quel brin sera la matrice lors de la transcription?

Answer 22

le promoteur

Question 23

Qu’est-ce qui détermine dans quel sens se fera la transcription?

Answer 23

le promoteur

Question 24

Quels sont les 3 facteurs déterminants d’un promoteur fort?

Answer 24

• la capacité du promoteur de lier l’ARN pol : + de points de contact = promoteur plus fort
• isomérisation complexe fermé à ouvert efficace
• la facilité qu’a l’ARN pol à échapper au promoteur

Question 25

V ou F. Quand un promoteur est « fort », c’est parce qu’il reste plus fortement attaché à l’ARN pol.

Answer 25

F. C’est parce que l’ARN pol se lie + souvent au promoteur, donc fait davantage de transcrits

Question 26

[Procaryotes] V ou F. La transcriptase ne peut se lier qu’aux promoteurs .

Answer 26

F. Elle peut se lier partout sur l’ADN techniquement, mais lorsque la sous-unité σ s’ajoute, elle force la transcriptase à ne se lier qu’aux promoteurs.

Question 27

[Procaryotes] Qu’est-ce que l’holoenzyme lors de la transcription?

Answer 27

c’est la transcriptase avec la sous-unité σ

Question 28

[Procaryotes] À quelle étape de l’initiation la transcriptase commence à se déplacer?

Answer 28

Pendant les 3 étapes de l’initiation, la transcriptase ne peut pas se déplacer : elle est prise sur le promoteur. C’est seulement à la transition du complexe ternaire stable vers l’élongation que l’ARN pol peut commencer à avancer

Question 29

[Procaryotes] À quelle étape de l’initiation la transcriptase commence à polymériser?

Answer 29

Elle commence à la 3e étape de l’initiation : le complexe initial de transcription. Mais attention : à cette étape ce n’est pas le début de la polymérisation de l’ARN, ce ne sont que de courts transcrits de 10 nt et moins qui sont synthétisés, puis relâchés.

Question 30

Lors de la transcription, les « positions » (-10, -35, +1, +10, etc.) correspondent à quoi? 3 choix :

• au brin d’ADN codant
• à l’ARN nouvellement transcrit
• au brin d’ADN matrice
• à la position de la transcriptase

Answer 30

à l’ARN nouvellement transcrit, où +1 est le 1er nucléotide de la chaîne