Chap 8 Bis : CYP450 Flashcards
Quel type de reaction catalyse les CYP450
Oxydation
CYP450 est quoi comme prot ?
Metaloprot avec une moitie d’heme (fer) liee de maniere covalente
Longeur d’absorption des CYP450 ?
450 nm ROUGE
Structure de CYP450 ?
14 helice à antiparallèles et 5 feuillets bêta chacun d’un cote
L’heme est au centre région hydrophobe liee a une CYS
Explique les etapes de la catalyse d’un cyp450
- liaison au substrat à proximité du site du ligand heme
- réduction du fer d’un électron (Fe3+ devient Fe2+) par la Flavoproteine de NADPH cytochrome P450 réductase
- Réaction du fer ferreux par l’O2 pour former un intermédiaire FE O2, peu stable.
- Transfert du deuxième électron de reductase NADPH ou de cytochrome B5.
- Scission hétérolytique de la forme FEO–O(H). ETAPE LIMITANTE
- Oxydation du substrat et abstraction formelle de l’atome d’hydrogène ou d’électrons.
- Recombinaison radicale.
- Libération du produit.
Est ce que le CYP450 est une enzyme parfaite ??
Noon sa catalyse a bcp d’etapes qui peuvent deboucher sur des voies non productives
Dans la structure du site actif de CYP450 y’a t il une fluctuation conformationnel ?
Ouii helice alpha bouge et laisse acces au canal
Quel est la structure du canal d’un CYP450 ?
Helice F G G’ et les 5 feuillets beta
La cavite du site actif est remplie de combien de mol h2O
5-6 et une boucle de AA aussi
Quel interaction domine au site actif ?
Interaction hydrophobe
Chez les différents CYP450 les sites actifs sont identiques ?
Noon poche de liaison tres flexible pour des substrats tres variés
Dans un CYP450 est ce qu’il y’a un seul canal ? Est ce que tout le monde l’emprunte ?
Non plusieurs canaux par exemple l’H2O et l’O2 ne prennent pas forcément le meme et le substrat non plus
Dans le CYP3A4 y’a combien de canaux pour que le substrat atteigne le site actif ? Et quel residus les bloques ?
6
Residus Phe qui doivent etre brises
Plus précisément dans le CYP3A4 combien de canaux ont accès a quoi ?
6 canaux
1 pour le solvant
5 pour substrats
Exemple avec CYP2C9 et ibuprofen ??
Ibuprofen rentre dans la Mb et est aspiré par un canal ensuite il devient hydrophile donc relache par autre canal dans le cytosol
A quoi sert une reductase du CYP450 ?
Partenaire du CYP450 qui fournie les electrons pour reduire Fe3+ en Fe2+
Combien d’electrons apporte le NADPH du cyp450 reductase ?
2 e mais le cyp peut accepter que un seul a la fois (cyp b5 peut participer aussi)
Particularité du CPR ? Oxydoreductase P450
2 cofacteurs FAD FMN qui sont dynamiques, deux formes possibles
Compact ou FAD/FMN rapprochés pour transfert e interflavine
Etendu ou FMN expose pour transfert au CYP450
Quelles interactions sur le complexe de rencontre favorise le transfert d’electron ?
Complementarite de charges des surfaces de CPR (aspartate et glutamate) et Cyp450 (lysine argine)
Aussi force hydrophobe
C’est quoi l’effet tunnel d’electron ?
C’est le domaine FMN qui s’approche de l’heme pour reduire la distance de 18A a 14A (voire 8A) ce qui augmenterait bcp le taux maximum de transfert d’electrons et rendrait notre modèle viable
Est que cyp1A1 et cpr forment toujours des complexes stables dans la mb du ER ??
Ouii avec une distance Fe-N5 de 14 - 16A le transfert d’e- est a son prime
As tu compris le principe de la theorie de tunnel quantique ? Qui a travaillé dessus ?
Oui sinon va lire ton cours
Rudolph Marcus
Theorie tunnel quantique : quels sont les facteurs importants ?
Effet de resistance
Distance
Est ce que les proteines avec des centres multiredox ont des separations de moins de 14A ??
Ouii
Exemple : Xanthyne Oxidase
