Ácidos Nucleicos Flashcards
Qual a diferença entre um nucléotido e um nucleósido?
Um nucleótido tem um grupo fosfato e um nucleosido não
Que 3 componentes constitui um nucleótido?
Uma base azotada, um açucar (ribose) e um grupo fosfato
Como se destingue a ribose da desoxirribose
A ribose tem um grupo OH no C2 e a desoxirribose tem um H
Quais são as bazes azotadas classificadas como purinas e pirimidinas?
Purinas - A e G
Pirimidinas - C e T (U)
Que tipo de ligação se estabelece entre o açucar e a base azotada num nucleótido?
Ligação beta-glicosídica
Qual dos 3 componentes dos nucleótidos contribui para a solubilidade das bases em meio aquoso?
Áçucares
A ligação glicosídica (entre o açucar e a base azotada) estabelece-se no N… nas pirimidinas e no N… nas purinas
9 e 1
Os nucleósidos podem adquirir duas conformações com base na rotação da ligação glicosídica, quais são?
Syn e Anti
Qual a conformação dos nucleosídos, syn ou anti é mais frequente na forma B de DNA?
Anti
As bases azotadas são estruturas planares ou não planares?
Planares
As bases azotadas têm um pico de absorção de radiação a que comprimento de onda?
260nm
As bases azotadas secundárias, normalmente apenas variam das principais por adição de um grupo…
Metilo
Dois exemplos de bases azotadas secundárias são:
5-Metilcitosina e N6-metiladenosina
Qual das bases azotadas secundárias, apenas existe em bactérias?
N6-metiladenosina
As bases azotadas secundárias têm que função?
São marcadores epigenéticos. Marcam o seu DNA de forma a degradarem o DNA bacteriano. Também marcam quais genes devem estar ativos (nos eucariontes)
As bases azotadas são moléculas carregadas ou neutras a pH fisiológico?
Neutras
Quando se diminui o pH o uracilo adquire diferentes formas. Como se chamam?
Forma lactâmica (ceto) a pH fisiológico, forma lactímica e forma lactímica dupla (enol) a pHs mais baixos
As bases azotadas são sintetizadas a partir de diferentes…
Aminoácidos
Na síntese das pirimidinas o aminoácido que contribuem com Ns e Cs é:
Aspartato
A enzima que catalisa a síntese das pirimidinas é:
ATCase (aspartato transcarbamoilase)
Na síntese das purinas, os aminoãcidos que contribuem são:
Glicina, Aspartato e Glutamina
Nos nucleótidos, os açucares são D ou L?
D
Os açucares dos nucleótidos podem apresentar conformações diferentes pois…
O C2 ou o C3 estão no mesmo plano do C5 (endo) ou em lados opostos (exo)
O grupo fosfato é carregado ou é neutro a pH fisiologico?
Carregado negativamente
Os ácidos nucleicos são sintetizados a partir de estruturas fosfatadas chamadas…
Nucleótidos trifosfato
V ou F. Os grupo fosfato estão exclusivamente ligados ao carbono 5 da ribose.
Falso. Podem ser encontrados noutras posições
A citosina desamina originando…
Uracilo
Como é que a natureza distingue os uracilos naturais dos de desaminação?
Substituindo os Us por timinas (5-metil-Uracilo) no DNA
Qual dos dois, DNA ou RNA é mais suscetível a hidrólise?
RNA
Como se chamam as ligações (na vertica) entre nucleótidos formando os ácidos nucleicos?
Ligações fosfodiéster
O RNA é instável em condições básicas ou ácidas?
Básicas.
Como é que um ambiente básico pode provocar hidrólise do RNA?
O OH- desprotona o OH do carbono 2 da ribose tornando-a um bom nucleófilo, que ataca o P do grupo fosfato, hidrolisando a ligação fosfodiéster
O que é a Lei de Chargaff?
A = T
C = G
e A + G = C + T
Que tipo de ligações se estabelece entre bases azotadas de duas cadeias de DNA?
Ligações de Hidrogénio
As bases azotadas ficam voltadas para o … e os açucares e grupos fosfato ficam voltados para o …
Interior e exterior
Quanto mede uma volta de hélice de DNA, e quantos pares de bases existem?
36 A (3,6nm) e 10,5 pares de bases
Na hélice dupla do DNA há zonas mais largas chamadas… e mais estreitas, os…
Major groove e minor groove
Nos major grooves, o que fazem as proteinas reguladoras?
Reconhecem padrões de bases e possibilidades de ligações de H
As regiões ricas em A-T ou C-G são mais estáveis?
C-G
A estrutura Watson e Crick é a forma A,B ou Z do DNA?
B
A forma A do DNA é mais larga/estreita, e tem … pares de bases por volta de DNA
Larga, 11
A forma Z é mais curta/alongada e tem … pares de bases por volta de DNA. Outra diferença é que rotação da hélice é à esquerda/direita.
Alongada, 12, esquerda
A polimerização do DNA é no sentido 5’ - 3’ ou 3’ - 5’?
5’ - 3’
Que enzima sintetiza a replicação do DNA?
DNA Polimerase
Como a fita de DNA gerada por replicação contém uma cadeia da fita mãe, a replicação e chamada de …
Semi-conservativa
Na desnaturação do DNA quais ligações se mantêm intactas?
As fosfodiester (covalentes)
Quando o DNA é hidrolisado a absorvância aumenta ou diminui?Como se chama este efeito?
Aumenta, Efeito hipercrómico
V ou F. A desnaturação do DNA é irreversível
Falso
O que é a temperatura de “melting” do DNA?
Temperatura para a qual 50% das moléculas de DNA estão desnaturadas
O annealing das cadeias de DNA é…
A renaturação
O DNA começa a desnaturar normalmente a uma temperatura acima de…
80ºC
A temperatura de melting aumenta ou diminui com o aumento das bases C-G? Porquê?
Aumenta. As bases C-G estão ligadas por 3 ligações H, sendo por isso mais dificeis de quebrar
Quais são os fatores que afetam a desnaturação do DNA?
-Composição em bases
-Comprimento da cadeia
-pH
-Força iónica
V ou F. O aumento da força iónica no meio, aumenta a temperatura de melting do DNA.
Verdadeiro
Qual a única função do DNA?
Armazenar e transmitir a informação genética
Que tipos de RNA existe?
-RNA mensageiro
-RNA ribossomal
-RNA de transferência
-snRNA
O que é o splicing?
Remoção dos intrões (zonas não codificantes) do RNA pré mensageiro
O rRNA constintui cerca de … da massa dos ribossomas
2/3
Por quantas subunidades são constituidos os ribossomas?
2
O que são estruturas de DNA palindrómicas?
Regiões de DNA com repetições invertidas que formam estruturas em forma de grampo (uma cadeia) e cruciformes (duas cadeias)
O tRNA é um pequeno o grande polinucleótido?
Pequeno (73 a 94 bases)
Qual é a sequência 3’ terminal no tRNA?
CCA-aa
No tRNA dá-se emparelhamento de bases non-Watson-Crick, que consiste em…
Emparelhamento de bases diferente do proposto pelo modelo de Watson-Crick (A-T e C-G)
Quais são as enzimas que reconhecem e clivam sequências específicas de DNA?
Endonucleases
Para isolar o DNA, as soluções utilizadas têm de conter:
SDS (detergente), EDTA e cloreto de sódio. Bem como enzimas Proteinase K e a Rnase
Para haver extração do DNA (precipitação das proteínas) usa-se o…
fenol-clorofórmio
Para além do fenol-clorofórmio, que outros reagentes se podem utilizar para a extração?
-Guanidinina, e tiocianato de sódio
A reação em cadeia polimerase começa com a…
Desnaturação do DNA a altas temperaturas (95ºC)
Que estruturas se ligam à extremidade das cadeias de DNA para inciar a replicação na PCR?
Primers (oligonucleótidos)
