5.2-structures moléculaires des gènes et chromosomes II Flashcards

1
Q

que se retrouve dans l’ADN non codant

A

gènes pour ARNr, ARNt, miARN et snRNA impiqués dans l’épissage

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2
Q

c’est quoi les 2 types de l’ADN non codant

A

1) ADN non codant de séquences répétées (contient gènes pour ARNs)
2) ADN non codant de courtes répétitions dispersées (éléments mobiles/transposables)

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3
Q

c’est quoi la transposition

A

quand l’ADN non codant est copié et inseré dans un nouveau site du génome

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4
Q

2 grandes catégories d’éléments mobiles

A

1) transposons d’ADN (3% du génome humain)
2) rétrotransposons (LINE est 21% du génome et SINE est 13% du génome)

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5
Q

c’est quoi les rétrotransposons

A

ceux qui se transposent par l’intermediaire d’un ARN transcrit à partir d’un élément mobile. Peuvent se convertit à nouveau en ADNdb par une transcriptase inverse

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6
Q

avantage et désavantage pour les transposons

A

avantage=mène à l’évolution
désavantage= peut inactiver gènes essentiels et ainsi tuer la cellules “hôte”

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7
Q

c’est quoi les séquences d’insertion (éléments IS)

A

un synonyme pour les transposons

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8
Q

3 composantes d’un transposon

A

1) région codante pour la transposase
2) région répétée inversée à chaque extrémité (50pb)
3) région répétée directe du site cible (5-11pb)

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9
Q

c’est quoi les 3 fonctions de la transposase

A

1) excise précisément le transposon de l’ADN donneur
2) effectue des coupures décalées dans une courte séquence de l’ADN accepteur
3) ligature des extrémités 3’ du transposon aux extrémités 5’ de l’ADN accepteur coupé

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10
Q

5 étapes de la transposition d’un transposon

A

1) transposase excise le transposon de lA’DN donneur
2) transposase coupe la séquence cible de l’ADN accepteur
3) transposase a une activité ligase qui attache le transposon à la séquence du receveur
4) ADNpoly remplit les séquences vides pour les 2 simples brins
5) ADN ligase réunit les extremités libres au transposon

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11
Q

2 types de rétrotransposons

A

1) avec les LTR (long terminal repeats)-agissent comme rétrovirus
2) sans les LTR (plus important chez mammifères)

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12
Q

c’est quoi la structure générale des rétrotransposons avec LTR (3 constituants)

A

1) région codante pour transcriptase inverse et intégrase
2) région répétée LTR à chque extremité (250-600pb)
3) région répétée directe du site cible (5-10pb)

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13
Q

2 types de rétrotransposons sans LTR

A

1) SINE (courtes séquences dispérsées)
2) LINE (longues séquences dispérsées)

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14
Q

structure générale du rétrotransposon LINE

A

1 ) région codante pour ORF1 et ORF2
2) région riche en A-T dans chaque extrémité
3) région répétée directe du site cible

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15
Q

rôle de ORF1

A

code pour protéine de liaison à l’ARN

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16
Q

rôle de ORF2

A

code pour protéine ayant activité de transcriptase inverse

17
Q

SINE vs LINE (2 différences)

A

1) SINE sont transcrits par ARNpoly III et n’a pas besoin de la queue polyA comme LINE
2) SINE ne code pas pour protéines, mais contient leur séquence dans une région 3’ riche en A/T