2.1 - Relations structures-fonctions

Question 1

Citer les différentes liaisons chimiques pour l’organisation d’une molécules ? (4)

Answer 1

• Liaison covalente : liaison peptidique (CO-NH), pont disulfure (S-S)
• Liaison ionique : entre deux atomes de charges électriques opposées
• Liaison hydrogène : entre un atome d’hydrogène « accepteur » et un autre atome « donneur »
• Interactions hydrophobes : tendance au regroupement de parties non polaires.

Question 2

Citer les différentes formes de protéines que l’on retrouve dans l’organisme ? (2)

Answer 2

-Protéines globulaires
De forme sphérique, solubles dans l’eau et associées à une grande variété de fonctions.
=> Elles peuvent être membranaires lorsqu’elles jouent le rôle de transporteur, de récepteurs, de canaux ioniques, d’adhérents cellulaires.
=> Elles peuvent être circulantes quand elles sont plasmatiques (ex. albumine) ou cytosoliques

• Protéines fibreuses
  De forme hélicoïdale autour d’un axe.
  => Elles peuvent être extracellulaires, donc insolubles dans l’eau pour assurer une fonction de protection ou de soutien (kératine, collagène, élastine).
  => Elles peuvent être intracellulaires (ex. myosine des cellules musculaires)

Question 3

Citer les différents niveaux de structures d’une protéine ? (4)

Answer 3

• Structure primaire
  Séquence d’acides aminés
• Structure secondaire
  Arrangement spatial régulier adopté par une chaîne (hélice, feuillet)
• Structure tertiaire (pour les formes globulaires) Arrangement stable d’une ou plusieurs chaînes dans l’espace
• Structure quaternaire
  Arrangement stable qui résulte de l’assemblage de plusieurs chaînes

Question 4

Citer les différentes formes de formules pour une molécule ? (3)

Answer 4

• formule brute
• formule plane : développée et semi-développée (contractions des liaisons C-H)
• formule spatiale :

Question 5

Qu’est ce que l’écriture topologique ?

Answer 5

Formule qui fait apparaître un squelette carboné sous forme de traits pleins et les atomes autres que C et H (sauf si H lié à un atome autre que C)

Question 6

Donner la définition de l’isomérie et les différentes formes de celui-çi ?

Answer 6

L’isomérie est la relation qui existe entre des formules planes qui se rapportent à la même formule brute.

• Isomérie de squelette
• Isomérie de position (d’une fonction)
• Isomérie de fonction

Question 7

Donner la définition de la stéréoisomérie ?

Answer 7

La stéréoisomérie est la relation qui existe entre des formules spatiales qui se rapportent à la même formule plane.

Question 8

Donner la définition de deux molécules énantiomères ?

Answer 8

Deux molécules avec deux formules spatiales qui sont images l’une de l’autre dans un miroir (non superposables), aux propriétés chimiques et biologiques différentes et qui décrivent deux configurations.

Question 9

Donner la définition et les spécificités d’une enzyme ?

Answer 9

• Les enzymes sont des protéines fabriquées par la cellule vivante
• Les enzymes sont des biocatalyseurs : il accélère de réactions chimiques dans l’organisme.
• Une enzyme est sélective : elle est spécifique d’une réaction et d’un nombre limité de substrat

Question 10

Donner la définition et les spécificités d’un récepteur ?

Answer 10

• Un récepteur désigne plus généralement une protéine de la membrane cellulaire, du cytoplasme ou du noyau cellulaire.
• Un récepteur se lie à un facteur spécifique appelé ligand (molécule informative).
• L’interaction ligand-récepteur induit une réponse cellulaire qui se prolonge à l’échelle de l’organisme par un effet biologique.

Question 11

Donner la définition des récepteurs enzymatiques ?

Answer 11

• Les récepteurs enzymes en position transmembranaire ou cytosolique possèdent une activité enzymatique

Question 12

Donner la définition des récepteurs canaux ?

Answer 12

• Les récepteurs canaux régulent le passage d’ions (Na+, Ca2+, Cl-)de l’extérieur vers l’intérieur de la cellule

Question 13

Donner la définition des récepteurs récepteurs couplés à une protéine G ?

Answer 13

Les récepteurs couplés à une protéine G sont constitués par 7 domaines (polypeptides en hélice) transmembranaires et leur activité nécessite la présence de GDP (guanosine-diphosphate)

Question 14

Donner la définition des récepteurs récepteurs nucléaires ?

Answer 14

Les récepteurs nucléaires sont situés dans le noyau de la cellule où se fixent par exemple des hormones stéroïdiennes (messagers lipophiles) ;
=> Ces récepteurs agissent généralement comme de facteurs de transcription et sont impliqués dans la régulation de processus fondamentaux (développement, reproduction, immunité…)

Question 15

Quelle est la particularité de l’interaction ligand-récepteur ?

Answer 15

L’interaction implique une complémentarité structurale entre le ligand et le récepteur.