18. Aminosyrer og proteiner

Question 1

• Giv en kortfattet beskrivelse
• Angiv relevante bindinger
• Organisationsniveauer i proteiners struktur på:

Primær struktur

Answer 1

Primær struktur:
Sekvensen af aminosyrer angivet fra N- til C- terminal.

Bindinger:
- Peptidbinding mellem aminosyrerne

Question 2

• Giv en kortfattet beskrivelse
• Angiv relevante bindinger
• Organisationsniveauer i proteiners struktur på:

Sekundær struktur

Answer 2

Sekundær struktur:
De regelmæssige foldninger af peptidkæden

Hovedtyper:
a-helix og ß-struktur (foldeblad)

H-bindinger:
- mellem N-H og C=O i peptidrygraden

Question 3

• Giv en kortfattet beskrivelse
• Angiv relevante bindinger
• Organisationsniveauer i proteiners struktur på:

Tertiær struktur

Answer 3

Tertiær struktur:
Den tredimensionale struktur af protein eller proteinsubunit

Hovedtyper:

• Kompakte eller globulære og typisk vandopløselige proteiner
• Langstrakte eller fiberagtige og typisk uopløselige i vand-proteiner

Bindinger: Alle tænktelige intermolekylære bindinger mellem aminosyresidegrupperne

• Elektrostatiske (flere kovalente molekyler)
• Hydrofobe
• H-bindinger
• Disulfidbindinger hos ekstracellulære proteiner

Question 4

• Giv en kortfattet beskrivelse
• Angiv relevante bindinger
• Organisationsniveauer i proteiners struktur på:

Kvaternær struktur

Answer 4

Kvaternær struktur:
Støkiometrisk veldefinerede aggregater af proteinsubunits;
- Både 2a og 2ß subunits i hæmoglobin

Bindinger:

• Elektrostatiske (flere kovalente molekyler)
• Hydrofobe
• H bindinger (mange)

Question 5

Hvad er en subunit i en proteinstruktur?

Answer 5

Subunit:

- Separat peptidkæde (proteinenhed), fx a- og ß-subunits i hæmoglobin

Question 6

Hvad er et domæne i en proteinstruktur?

Answer 6

Domæne:

- Små afsnit på samme peptidkæde (subunit) adskilt af løsere strukturer (random coil), fx i albumin og immunoglobuliner

Question 7

Hvis man hydrolyserer Asn, asparagin hvad sker der med aminosyren?

Answer 7

Den hydrolyseres til Asp, aspartat.

Da asparagin, Asn, NH2 gruppe bliver hydrolyseret til NH3 og fjernes fra sidekæden.

Question 8

Hvad betyder det isoelektriske punkt?

Answer 8

Isoelektrisk punkt:

- Molekylets ladning skal være = 0

Question 9

Beskriv albumin herunder funktion, hvilke molekyler albumin kan transportere og hvordan albumin transporterer molekyler?

Answer 9

Albumin er et polært plasmaprotein, der fylder 50% af alle proteinerne i blodet. Albumin har hydrofobe lommer hvor den kan binde og dermed transportere: BH SFK

• Bilirubin
• Hæm
• Steroider (hormoner og farmaca)
• Langkædede fedtsyrer (kortere fedtsyrer
• Kationer (fx Ca2+)

Albumin kan reversibelt binde og transportere ovenstående pga. ‘hydrofobe kløfter/lommer’

Question 10

Hvad kan unormal Hydrogen ion koncentration føre til i kroppen?

Answer 10

Acidose og Alkalose

Acidose:
- Syreforgiftning, hvis blodets pH er mindre end 7,36
Øget ventilation, øget CO2 i blodet

Alkalose:
- Baseforgiftning, hvis blodets pH er mere end 7,42
Øget ventilation, nedsat CO2 i blodet

Question 11

Seglcelleanæmi er en mutation i proteinstruktur, hvordan kan det forklares?

Answer 11

Seglcelleanæmi ændrer hæmoglobinets struktur.

Én aminosyreændring i primærstrukturen bevirker til ændringer i sekundær- og tertiærstrukturen som fører til seglcelleanæmi.

Det ændrede protein bliver fibrøst under lave oxygen forhold, hvilket får de røde blodlegemer til at få et seglcelleformet udseende.